陕西行都司位于河西走廊中段，治所甘州卫，领十二卫，四守御千户所，距陕西承宣布政使司二千六百四十五里，隶属于右军都督府。
这些是崇正朝以前对于陕西行都司的官方记载，但是，自崇正朝以来，特别是自孙传庭镇守西北以来，陕西行都司管辖的卫所已经远不止这些。
自崇正十一年起，孙传庭开始驻守西北，并按朱慈炅的指示，不断向西扩张，一路收复了赤斤蒙古卫、沙州卫、罕东卫、哈密卫等羁縻卫所，使陕西行都司的辖区扩大了将近一倍。
要说哈密卫、赤斤蒙古卫、罕东卫等卫所当初其实并不是陕西行都司下属的卫所，而是由大明指定的番王驻守的羁縻卫所，也就是地方军政都由归顺大明的番王掌控，有点类似于土司性质。
哈密卫等地一开始其实是由大明册封的忠顺王管辖，这忠顺王一系源自蒙元时期的察合台汗国，大明永乐二年，驻守在哈密的察合台汗国威武王安克帖木儿归顺大明，被诏封为忠顺王，自此忠顺王一系就一直为大明驻守西北门户哈密卫，一直延续了十一代。
到正德年间，大明国势日衰，哈密卫被临近的吐蕃汗所据，而后几经得失，许多大臣都因哈密卫得而复失受牵连，被诛杀，后面渐渐无人敢再问哈密卫之事，明军从此全面退守嘉峪关。
直到崇正十一年，孙传庭负责镇守西北，明军才开始再次踏足嘉峪关外。
此时，吐蕃早已被察合台汗国给灭了，察合台汗国也被瓦刺的和硕特部和绰噶尔部联合起来给灭了，盘踞在哈密卫等地的其实是察合台汗国的一些残余势力，收拾起来并不怎么费手脚。
固始汗之所以一直没有进攻哈密卫，是因为哈密卫从永乐年间开始就是大明的领土了，他怕冒然去进攻会引起大明的报复，那时候新帐老账一起算，他可扛不住。
瓦刺部不敢来，正好便宜了孙传庭，盘踞在哈密卫等地的察合台汗国余部就是无根之萍，怎么敢对抗大明天军，他们选择了和先祖威武王安克帖木儿一样的策略：投降大明！
不过，这次大明可没有那么客气了，朱慈炅并没有诏封他们的首领为王，哈密卫等地也不再由他们自治，而是直接划入陕西行都司，由孙传庭掌管。
此时，秦军的总部已经由西安府迁至甘州卫，整个陕西行都司的军政大权，全部由孙传庭接管，他手下不但有十万秦军，还有领有十八个卫所，四个守御千户所大约十万屯卫，兵力之盛，可谓冠绝整个大明所有军团。
当然，他肩上的担子也不轻，整个西北地区现在可就剩下他这一路大军了，他不但要负责抵御蒙元瓦刺部的入侵，还要负责震慑西北各地的土司势力，还好鞑靼被征服以后漠南变成了大明的一个行省，不然，他又要防守西边，又要震慑南部，还要提防北方，非得忙死不可。
自孙传庭镇守西北以来，陕西行都司的变化可谓翻天覆地。
这里面最大的变化当属西北铁路的建设，在他和陈子龙的共同努力下，西北铁路已经从西安府通到了嘉峪关。
他这三四年可不光是钉在甘州操练军队，地方上的建设他一点都没拉下，西安府到嘉峪关可谓关山重重，硬是被他带着十万屯卫跨越千山，把铁路给修通了。
这铁路修通以后也不光是方便了粮草辎重的运送，对平民百姓也有莫大的好处。
现在，嘉峪关内的肃州卫已经成为明商的聚集地，大明各地生产的锅碗瓢盆、油盐酱醋、衣服鞋帽、绫罗绸缎、玻璃镜子等等，在这里都能买到。
嘉峪关外的瓜州卫则成为胡商的聚集地，西域各地盛产的香料、皮货、药材、马匹等，在这里也随处可见。
每天，从肃州卫到瓜州卫的商队络绎不绝，排成了一条条长龙，古丝绸之路自此重获新生。
当然，如果能把铁路从嘉峪关修到哈密卫，那不管是从军事上还是经济上都将产生巨大的作用，但是，关外的风沙太大，铁路建好以后，如果没一点防护，有可能一场大风就把铁路线给罩住了，那时候清理起来可就麻烦了。
所以，孙传庭并没有急于把铁路修到哈密卫，而是向陈子龙请教，找来了各种抗旱能力超强的花草树木，经过三四年的试种和推广，从嘉峪关到哈密卫之间已经形成了一条宽约百里的黄绿通道。
各种抗旱植株在关外的荒原上顽强的生长着，沙洲上不再是一片茫茫的黄沙，中间的绿点越来越多，渐渐有覆盖整个沙洲的趋势，或许，再过几年，嘉峪关到哈密卫的铁路就可以开工了。
哈密卫虽然还没有通铁路，孙传庭对关外的防御却一点都没有放松，各处的卫所已经被他翻新或者重建，秦军也被他分成了五部分，分散在陕西行都司各处重要关隘。
关外所有卫所中，变化最大的当属哈密卫，明军刚收复哈密卫时，哈密卫的居民不过三四千人，而且大多是蒙元后裔畏兀儿和哈剌灰。
秦军来了以后，不但将卫所扩大到原来的三四倍，还在外围新建了十个千户所，让屯卫试种各种抗旱农作物，争取做到粮草的自给自足。
现在，整个哈密卫辖区内攻驻有秦军步兵一万，炮兵五千，屯卫一万余户，再加上原来的住户，人口差不多已经达到十万！
另外，沙州卫和罕东卫也经过了翻新和扩建，分别驻有秦军步兵一万和屯卫五千，这样算下来，整个关外就驻有秦军三万五千和屯卫两万。
而边防重镇嘉峪关同样驻有步兵一万和炮兵五千，剩下的五万精骑则全部驻守在甘州卫附近，至于原来陕西行都司的十二个卫所，主要还是以屯卫为主。
孙传庭之所以这么安排，主要还是为了防御蒙元瓦刺部的进攻，至于其他地方，有五万精骑足矣，现在大明的铁路线已经通到了各个行省，西北各省的土司如果不老实，直接用铁路把骑兵运到附近，然后一通狂奔，他们基本刚起事几天，就会遭遇灭顶之灾！
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