在一个雷雨天，贫民窟的街头，一个少年趴在地上，周围的居民好奇的上去查看少年的外貌：蓝色的外套，左手一个旧版决斗盘，白色头发，过了一会，少年恢复了意识，站了起来，但是他却摸着自己的头，向众人问道：“我是谁？”
时间转眼到了五年后，在太空中的决斗战场，名为巫女的决斗者在和对手决斗：“那么，结束了，诡计明星戴薇尔菲妮姆，攻击码语者！”戴薇尔菲妮姆用法杖释放出一道蓝色的光芒，冲过码语者直接击倒了对手，仅仅100的生命值直接被击破。“胜负已定！胜利者是巫女！让我们恭喜巫女获得十五连胜！”巫女高兴的向着观众席放出一个飞吻，然后调皮的说：“谢谢大家支持！”说完，离开了决斗战场。
在高级决斗学院，巫女醒来了，她的名字，叫玛雅，是链接决斗社团团长，但是，虽然说是决斗社团，但是队员们却一次也没有赢过，以至于，链接决斗社团成为了校排名最后一名的决斗社团。
玛雅看着在自顾自决斗的队员，叹了一口气，然后走向电脑，打开邮箱后，出现了一封邮件，邮件上写着：尊敬的玛雅，现考虑链接决斗社团已连续排名校最后一名多次，所以在今年的链接决斗大会举行完毕之后，将把链接决斗社团解散，致辞。玛雅心中一震：解散链接决斗社团，这对玛雅来说是非常大的打击，毕竟这是已故的哥哥赋予自己的使命，而在她的手上就要结束，她真的很伤心。
看向那些社团团员，她还是妥协了，然后走出社团活动室。回家了。
在家里，玛雅放下书包，爸爸问：“玛雅，回来了？”玛雅应了一声：“嗯。”机器管家也上前问好：“欢迎回来，玛雅小姐。”看着玛雅心情忧郁，又问：“怎么了，玛雅小姐？是遇到什么不开心的事情了？”玛雅说：“没事，没什么我就回房间了。”爸爸说：“是遇到什么问题了吗？”玛雅说：“没什么。”然后就关上了房门。
第二天是周末，玛雅打开了决斗连接器，再次来到了太空链接基地。
“还是找点事情做，分散一下注意力吧。”玛雅这样想着，然后走向决斗战场。这时，一个人进入了玛雅的视线：身穿白色战袍，头顶着蓝色头发的人在进行决斗，“战斗了！用［十二星兽-狂狮］攻击［解码语者］！”一只蓝色的狮子接到指令后，一发蓝色的利爪直接把码语者给击败，然后击败了一千点生命值的对手。
“哦耶！恭喜星皇骑士拿下第三连胜！”在周围观众的欢呼声中，星皇骑士走向还没有消失的狂狮，说：“谢谢你。”然后目送狂狮离开了自己的视线。
玛雅在旁边看着，诺有所思的说：“［十二星兽-狂狮］？我怎么没见过这张卡呢？”这时，在外面突然传来了一阵爆炸声和惨叫声，玛雅回头一看：一个人站在青眼白龙的头上，说：“出来！星皇子！”说着，青眼白龙还在向着周围放出蓝色的光炮。
玛雅吃惊的说：“青眼白龙？可是？怎么会破坏这个地方呢？”在玛雅吃惊的时候，青眼白龙已经走到了自己的面前，然后放出蓝色龙息，直径攻向玛雅。在击中玛雅的前一刻，一个白色的身影冲了过去把玛雅救了下来。蓝色的龙息直接打空了。那个人说：“谁？出来！”在烟雾中，星皇骑士走了出来，说：“为了找一个人就要把宇宙链接基地给破坏掉，真的有点可惜了吧。”那个人说：“你是谁？难道想要管我们追猎者的事情？”星皇骑士说：“我不能容忍的事情有三个：第一，伤害他人性命，第二，以强欺弱，第三…”说着，看向那个追猎者：“就是利用怪兽破坏所有人共享的家园！”追猎者说：“哼，故弄玄虚，你倒是击败我啊，小子。”星皇骑士举起决斗盘说：“你说的！启动权限：开启决斗风暴！”话音未落，周围飘起了紫色的通道，星皇骑士拿出D板（暂时这么说吧）踏上链接通道，后面的追猎者也拿出D板追了上去，星皇骑士说：“来吧，高速决斗！”说着，和追猎者抽出来四张卡，各显示出来四千点生命值。玛雅连忙启动追踪眼镜，找到了星皇骑士和追猎者的决斗，追猎者说：“先攻归我了！我发动永续魔法：［龙机生成器］。”话音未落，一张魔法卡在场上现身了。“这张卡的效果是：支付一千点生命值，把一只［机龙衍生物］在自己场上攻击表示特殊召唤。”说着，场上就出现了一只机龙繁衍物，“而且可以使用第二次，对吧？”星皇骑士说着，然后追猎者的场上再次出现了一只机龙繁衍物。“没错，那么接下来，从手卡上级召唤［青眼白龙！］”话音未落，两只机龙繁衍物直接消失，转眼间出现的是一只攻击力为三千点的青眼白龙。星皇骑士说：“一转眼就召唤出了青眼白龙啊。”追猎者说：“盖放一张卡，回合结束。”
星皇骑士查看了一下情况：对手现在场上有三张卡：［青眼白龙］和［机龙生成器］还有一张盖卡，而星皇骑士现在的手卡，只能巩固防御，抽出一张卡，说：“我的回合，发动魔法卡：［等价交换］，新手卡把一张最高星级的怪兽送去墓地，从卡组抽两张卡，我把［梦言狂战士］送去墓地，抽一张卡。”说着，把［梦言狂战士］送去了墓地。“接着发动［梦言狂战士］效果：从手卡，卡组送去墓地时，可以特殊召唤两只［疯狂繁衍物］。”话音未落，两个战斧样子的繁衍物怪兽在场上出现，“然后发动魔法卡：［死而复生］，破坏场上两只特殊召唤的怪兽，把一只怪兽从墓地特殊召唤，我把两只［疯狂繁衍物］送去墓地，特殊召唤［梦言狂战士］。”话音刚落，两只［疯狂繁衍物］就被破坏掉，碎片聚合成刚刚送去墓地的［梦言狂战士］，一看［梦言狂战士］的攻击力：只是区区的一千点，追猎者嘲笑着说：“哈哈哈，召唤这只攻击力低的怪兽有什么用？”
“我再发动［梦言游侠］的效果：场上有一只名字带有［梦言］的怪兽特殊召唤时，可以把自己从手卡特殊召唤。”话音刚落，拿着弓箭的游侠骑士出现在星皇骑士的场上。“接着普通召唤［梦言吸血鬼］。”这样，星皇骑士的场上出现了三只怪兽，他说：“出现吧：创造奇迹之路的回路！”一挥手，出现了链接标记点，“箭头，确认，我把［梦言游侠］作为链接素材，链接召唤［十二星兽-双鱼］！”［梦言游侠］化为箭头点亮了正下方的链接标记，然后从里面出现了两只小鱼。“接着发动［梦言吸血鬼］效果：作为链接素材送去墓地时，对方一只怪兽攻击力减半！”追猎者说：“不会让你得逞的！发动陷阱卡：［吸入暗阴的魔镜］，只要这张卡在场上存在，墓地或者场上发动的暗属性怪兽的效果无效。”而［梦言吸血鬼］，恰好就是暗属性的，星皇骑士说：“不碍事，再次出现吧：创造奇迹之路的回路！”随着链接标记点的再次出现，星皇骑士说：“发动［十二星兽-双鱼］效果：把自己和链接段的怪兽同时当做链接素材的回合，可以作为两个链接素材使用。”说着，把双鱼和链接段存在的梦言狂战士送去墓地。
这时，在天台大楼，三个人在看着星皇骑士和追猎者的决斗，为首的红色衣服摇摇头：“这家伙，居然和不相干的人干上了。”绿色衣服说：“那现在怎么办？要不要通知black-king？”红色衣服说：“暂时不用，我要看看这个自称星皇骑士的家伙有多大的能耐，敢跟我们追猎者对上。”
“链接召唤：出现吧！链接三：［十二星兽-狂狮］！”在三个标记电量之后，星皇骑士召唤出了两千攻击力的十二星兽-狂狮，“发动［十二星兽-狂狮］效果：链接段每存在一只怪兽，攻击力提高五百点。狂兽血性！”在狂狮的链接段，有［梦言狂战士］和［青眼白龙］。于是攻击力提高到了三千点。
“这样，击败你的条件就聚齐了。”星皇骑士说。
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